Crystal structure of Grouper nervous necrosis virus-like particle at 3.6A

PDB ID: 4WIZ
Gene source organism: Epinephelus coioides nervous necrosis virus
Expression organism: Escherichia coli Deposition date: 2014-09-28
Classification: VIRUS
Keywords: Virus, Betanodavirus
Technique: X-RAY DIFFRACTION
Assembly: 1
Resolution: 3.6
R-value: 0.2546
Metal site idBound amino acidsBound ligands IDs
4WIZ-CA-1 D2E1S1 ASP AA.130 ASP AA.133 GLU BA.213 SER BA.170
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4WIZ-CA-29 D2E1S1 ASP CE.130 ASP CE.133 GLU AE.213 SER AE.170
4WIZ-CA-30 D2E1S1 ASP CE.130 ASP CE.133 GLU AE.213 SER AE.170
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4WIZ-CA-36 D2E1S1 ASP CF.130 ASP CF.133 GLU AF.213 SER AF.170
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4WIZ-CA-40 D2E1Q1S1 ASP BG.130 ASP BG.133 GLN CG.100 GLU CG.213 SER CG.170
4WIZ-CA-41 D2E1S1 ASP CG.130 ASP CG.133 GLU AG.213 SER AG.170
4WIZ-CA-42 D2E1S1 ASP CG.130 ASP CG.133 GLU AG.213 SER AG.170
4WIZ-CA-43 D2E1S1 ASP AH.130 ASP AH.133 GLU BH.213 SER BH.170
4WIZ-CA-44 D2E1S1 ASP AH.130 ASP AH.133 GLU BH.213 SER BH.170
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4WIZ-CA-53 D2E1S1 ASP CI.130 ASP CI.133 GLU AI.213 SER AI.170
4WIZ-CA-54 D2E1S1 ASP CI.130 ASP CI.133 GLU AI.213 SER AI.170
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4WIZ-CA-60 D2E1S1 ASP CJ.130 ASP CJ.133 GLU AJ.213 SER AJ.170
4WIZ-CA-61 D2E1S1 ASP AK.130 ASP AK.133 GLU BK.213 SER BK.170
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4WIZ-CA-66 D2E1S1 ASP CK.130 ASP CK.133 GLU AK.213 SER AK.170
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4WIZ-CA-77 D2E1S1 ASP CM.130 ASP CM.133 GLU AM.213 SER AM.170
4WIZ-CA-78 D2E1S1 ASP CM.130 ASP CM.133 GLU AM.213 SER AM.170
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4WIZ-CA-80 D2E1S1 ASP AN.130 ASP AN.133 GLU BN.213 SER BN.170
4WIZ-CA-81 D2E1Q1S1 ASP BN.130 ASP BN.133 GLN CN.100 GLU CN.213 SER CN.170
4WIZ-CA-82 D2E1Q1S1 ASP BN.130 ASP BN.133 GLN CN.100 GLU CN.213 SER CN.170
4WIZ-CA-83 D2E1S1 ASP CN.130 ASP CN.133 GLU AN.213 SER AN.170
4WIZ-CA-84 D2E1S1 ASP CN.130 ASP CN.133 GLU AN.213 SER AN.170
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4WIZ-CA-88 D2E1Q1S1 ASP BO.130 ASP BO.133 GLN CO.100 GLU CO.213 SER CO.170
4WIZ-CA-89 D2E1S1 ASP CO.130 ASP CO.133 GLU AO.213 SER AO.170
4WIZ-CA-90 D2E1S1 ASP CO.130 ASP CO.133 GLU AO.213 SER AO.170
4WIZ-CA-91 D2E1S1 ASP AP.130 ASP AP.133 GLU BP.213 SER BP.170
4WIZ-CA-92 D2E1S1 ASP AP.130 ASP AP.133 GLU BP.213 SER BP.170
4WIZ-CA-93 D2E1Q1S1 ASP BP.130 ASP BP.133 GLN CP.100 GLU CP.213 SER CP.170
4WIZ-CA-94 D2E1Q1S1 ASP BP.130 ASP BP.133 GLN CP.100 GLU CP.213 SER CP.170
4WIZ-CA-95 D2E1S1 ASP CP.130 ASP CP.133 GLU AP.213 SER AP.170
4WIZ-CA-96 D2E1S1 ASP CP.130 ASP CP.133 GLU AP.213 SER AP.170
4WIZ-CA-97 D2E1S1 ASP AQ.130 ASP AQ.133 GLU BQ.213 SER BQ.170
4WIZ-CA-98 D2E1S1 ASP AQ.130 ASP AQ.133 GLU BQ.213 SER BQ.170
4WIZ-CA-99 D2E1Q1S1 ASP BQ.130 ASP BQ.133 GLN CQ.100 GLU CQ.213 SER CQ.170
4WIZ-CA-100 D2E1Q1S1 ASP BQ.130 ASP BQ.133 GLN CQ.100 GLU CQ.213 SER CQ.170
4WIZ-CA-101 D2E1S1 ASP CQ.130 ASP CQ.133 GLU AQ.213 SER AQ.170
4WIZ-CA-102 D2E1S1 ASP CQ.130 ASP CQ.133 GLU AQ.213 SER AQ.170
4WIZ-CA-103 D2E1S1 ASP AR.130 ASP AR.133 GLU BR.213 SER BR.170
4WIZ-CA-104 D2E1S1 ASP AR.130 ASP AR.133 GLU BR.213 SER BR.170
4WIZ-CA-105 D2E1Q1S1 ASP BR.130 ASP BR.133 GLN CR.100 GLU CR.213 SER CR.170
4WIZ-CA-106 D2E1Q1S1 ASP BR.130 ASP BR.133 GLN CR.100 GLU CR.213 SER CR.170
4WIZ-CA-107 D2E1S1 ASP CR.130 ASP CR.133 GLU AR.213 SER AR.170
4WIZ-CA-108 D2E1S1 ASP CR.130 ASP CR.133 GLU AR.213 SER AR.170
4WIZ-CA-109 D2E1S1 ASP AS.130 ASP AS.133 GLU BS.213 SER BS.170
4WIZ-CA-110 D2E1S1 ASP AS.130 ASP AS.133 GLU BS.213 SER BS.170
4WIZ-CA-111 D2E1Q1S1 ASP BS.130 ASP BS.133 GLN CS.100 GLU CS.213 SER CS.170
4WIZ-CA-112 D2E1Q1S1 ASP BS.130 ASP BS.133 GLN CS.100 GLU CS.213 SER CS.170
4WIZ-CA-113 D2E1S1 ASP CS.130 ASP CS.133 GLU AS.213 SER AS.170
4WIZ-CA-114 D2E1S1 ASP CS.130 ASP CS.133 GLU AS.213 SER AS.170
4WIZ-CA-115 D2E1S1 ASP AT.130 ASP AT.133 GLU BT.213 SER BT.170
4WIZ-CA-116 D2E1S1 ASP AT.130 ASP AT.133 GLU BT.213 SER BT.170
4WIZ-CA-117 D2E1Q1S1 ASP BT.130 ASP BT.133 GLN CT.100 GLU CT.213 SER CT.170
4WIZ-CA-118 D2E1Q1S1 ASP BT.130 ASP BT.133 GLN CT.100 GLU CT.213 SER CT.170
4WIZ-CA-119 D2E1S1 ASP CT.130 ASP CT.133 GLU AT.213 SER AT.170
4WIZ-CA-120 D2E1S1 ASP CT.130 ASP CT.133 GLU AT.213 SER AT.170
4WIZ-CA-121 D2E1S1 ASP AU.130 ASP AU.133 GLU BU.213 SER BU.170
4WIZ-CA-122 D2E1S1 ASP AU.130 ASP AU.133 GLU BU.213 SER BU.170
4WIZ-CA-123 D2E1Q1S1 ASP BU.130 ASP BU.133 GLN CU.100 GLU CU.213 SER CU.170
4WIZ-CA-124 D2E1Q1S1 ASP BU.130 ASP BU.133 GLN CU.100 GLU CU.213 SER CU.170
4WIZ-CA-125 D2E1S1 ASP CU.130 ASP CU.133 GLU AU.213 SER AU.170
4WIZ-CA-126 D2E1S1 ASP CU.130 ASP CU.133 GLU AU.213 SER AU.170
4WIZ-CA-127 D2E1S1 ASP AV.130 ASP AV.133 GLU BV.213 SER BV.170
4WIZ-CA-128 D2E1S1 ASP AV.130 ASP AV.133 GLU BV.213 SER BV.170
4WIZ-CA-129 D2E1Q1S1 ASP BV.130 ASP BV.133 GLN CV.100 GLU CV.213 SER CV.170
4WIZ-CA-130 D2E1Q1S1 ASP BV.130 ASP BV.133 GLN CV.100 GLU CV.213 SER CV.170
4WIZ-CA-131 D2E1S1 ASP CV.130 ASP CV.133 GLU AV.213 SER AV.170
4WIZ-CA-132 D2E1S1 ASP CV.130 ASP CV.133 GLU AV.213 SER AV.170
4WIZ-CA-133 D2E1S1 ASP AW.130 ASP AW.133 GLU BW.213 SER BW.170
4WIZ-CA-134 D2E1S1 ASP AW.130 ASP AW.133 GLU BW.213 SER BW.170
4WIZ-CA-135 D2E1Q1S1 ASP BW.130 ASP BW.133 GLN CW.100 GLU CW.213 SER CW.170
4WIZ-CA-136 D2E1Q1S1 ASP BW.130 ASP BW.133 GLN CW.100 GLU CW.213 SER CW.170
4WIZ-CA-137 D2E1S1 ASP CW.130 ASP CW.133 GLU AW.213 SER AW.170
4WIZ-CA-138 D2E1S1 ASP CW.130 ASP CW.133 GLU AW.213 SER AW.170
4WIZ-CA-139 D2E1S1 ASP AX.130 ASP AX.133 GLU BX.213 SER BX.170
4WIZ-CA-140 D2E1S1 ASP AX.130 ASP AX.133 GLU BX.213 SER BX.170
4WIZ-CA-141 D2E1Q1S1 ASP BX.130 ASP BX.133 GLN CX.100 GLU CX.213 SER CX.170
4WIZ-CA-142 D2E1Q1S1 ASP BX.130 ASP BX.133 GLN CX.100 GLU CX.213 SER CX.170
4WIZ-CA-143 D2E1S1 ASP CX.130 ASP CX.133 GLU AX.213 SER AX.170
4WIZ-CA-144 D2E1S1 ASP CX.130 ASP CX.133 GLU AX.213 SER AX.170
4WIZ-CA-145 D2E1S1 ASP AY.130 ASP AY.133 GLU BY.213 SER BY.170
4WIZ-CA-146 D2E1S1 ASP AY.130 ASP AY.133 GLU BY.213 SER BY.170
4WIZ-CA-147 D2E1Q1S1 ASP BY.130 ASP BY.133 GLN CY.100 GLU CY.213 SER CY.170
4WIZ-CA-148 D2E1Q1S1 ASP BY.130 ASP BY.133 GLN CY.100 GLU CY.213 SER CY.170
4WIZ-CA-149 D2E1S1 ASP CY.130 ASP CY.133 GLU AY.213 SER AY.170
4WIZ-CA-150 D2E1S1 ASP CY.130 ASP CY.133 GLU AY.213 SER AY.170
4WIZ-CA-151 D2E1S1 ASP AZ.130 ASP AZ.133 GLU BZ.213 SER BZ.170
4WIZ-CA-152 D2E1S1 ASP AZ.130 ASP AZ.133 GLU BZ.213 SER BZ.170
4WIZ-CA-153 D2E1Q1S1 ASP BZ.130 ASP BZ.133 GLN CZ.100 GLU CZ.213 SER CZ.170
4WIZ-CA-154 D2E1Q1S1 ASP BZ.130 ASP BZ.133 GLN CZ.100 GLU CZ.213 SER CZ.170
4WIZ-CA-155 D2E1S1 ASP CZ.130 ASP CZ.133 GLU AZ.213 SER AZ.170
4WIZ-CA-156 D2E1S1 ASP CZ.130 ASP CZ.133 GLU AZ.213 SER AZ.170
4WIZ-CA-157 D2E1S1 ASP Aa.130 ASP Aa.133 GLU Ba.213 SER Ba.170
4WIZ-CA-158 D2E1S1 ASP Aa.130 ASP Aa.133 GLU Ba.213 SER Ba.170
4WIZ-CA-159 D2E1Q1S1 ASP Ba.130 ASP Ba.133 GLN Ca.100 GLU Ca.213 SER Ca.170
4WIZ-CA-160 D2E1Q1S1 ASP Ba.130 ASP Ba.133 GLN Ca.100 GLU Ca.213 SER Ca.170
4WIZ-CA-161 D2E1S1 ASP Ca.130 ASP Ca.133 GLU Aa.213 SER Aa.170
4WIZ-CA-162 D2E1S1 ASP Ca.130 ASP Ca.133 GLU Aa.213 SER Aa.170
4WIZ-CA-163 D2E1S1 ASP Ab.130 ASP Ab.133 GLU Bb.213 SER Bb.170
4WIZ-CA-164 D2E1S1 ASP Ab.130 ASP Ab.133 GLU Bb.213 SER Bb.170
4WIZ-CA-165 D2E1Q1S1 ASP Bb.130 ASP Bb.133 GLN Cb.100 GLU Cb.213 SER Cb.170
4WIZ-CA-166 D2E1Q1S1 ASP Bb.130 ASP Bb.133 GLN Cb.100 GLU Cb.213 SER Cb.170
4WIZ-CA-167 D2E1S1 ASP Cb.130 ASP Cb.133 GLU Ab.213 SER Ab.170
4WIZ-CA-168 D2E1S1 ASP Cb.130 ASP Cb.133 GLU Ab.213 SER Ab.170
4WIZ-CA-169 D2E1S1 ASP Ac.130 ASP Ac.133 GLU Bc.213 SER Bc.170
4WIZ-CA-170 D2E1S1 ASP Ac.130 ASP Ac.133 GLU Bc.213 SER Bc.170
4WIZ-CA-171 D2E1Q1S1 ASP Bc.130 ASP Bc.133 GLN Cc.100 GLU Cc.213 SER Cc.170
4WIZ-CA-172 D2E1Q1S1 ASP Bc.130 ASP Bc.133 GLN Cc.100 GLU Cc.213 SER Cc.170
4WIZ-CA-173 D2E1S1 ASP Cc.130 ASP Cc.133 GLU Ac.213 SER Ac.170
4WIZ-CA-174 D2E1S1 ASP Cc.130 ASP Cc.133 GLU Ac.213 SER Ac.170
4WIZ-CA-175 D2E1S1 ASP Ad.130 ASP Ad.133 GLU Bd.213 SER Bd.170
4WIZ-CA-176 D2E1S1 ASP Ad.130 ASP Ad.133 GLU Bd.213 SER Bd.170
4WIZ-CA-177 D2E1Q1S1 ASP Bd.130 ASP Bd.133 GLN Cd.100 GLU Cd.213 SER Cd.170
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