Cryo-EM structure of TMV with Ca2+ at low pH

PDB ID: 6SAG
Metal site ID: 6SAG-CA-9
Bound amino acids or nucleotide residues: E1N2P1
Group identifier: N2P1T3
Is homomeric: True
Amino acid or nucleotide residue IDs: ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 PRO A.102
All ligands IDs: ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
Number of coordinating amino acids or nucleotide residues: 4
Number of coordinating ligands: 6
Number of coordinating chains: 2
Number of coordinating chains: 2
Representative metal site in the group: 6SAG-CA-10
Similar binding_sites:
Metal site idBound amino acidsBound ligands IDs
6SAG-CA-11E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-12E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-13E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-14E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-15E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-16E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-17E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-18E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-2E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-21E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-23E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-24E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-25E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-26E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-27E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-28E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-30E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-31E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-33E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-34E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-35E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-36E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-38E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-39E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-4E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-5E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-6E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-7E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-8E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102
6SAG-CA-9E1N2P1 ASN A.101 ASN A.98 GLU A.106 HOH A.347 HOH A.360 PRO A.102