| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5YL1-CA-22 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-23 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-24 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-25 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-26 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-27 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-28 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-29 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-30 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-31 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-32 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-33 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-34 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-35 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-36 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-37 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-38 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-39 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-40 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-41 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |