| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6J4J-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 5 | 7 | 3 | ✔ |
| 6J4J-MG-2 | MG | Mg²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 5 | 7 | 3 | ✘ |
| 6J4J-MG-3 | MG | Mg²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 5 | 7 | 3 | ✘ |
| 6J4J-MG-4 | MG | Mg²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 5 | 7 | 3 | ✘ |
| 7JGN-NA-3 | NA | Na⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 7JGN-NA-7 | NA | Na⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-7 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-8 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-9 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-10 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-11 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6WYH-CA-12 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6H6U-CA-5 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6H6U-CA-6 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6H6U-CA-7 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 6H6U-CA-8 | CA | Ca²⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 7KE5-FE-1 | FE | Fe³⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 7KE5-FE-2 | FE | Fe³⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 7KE5-FE-3 | FE | Fe³⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |
| 7KE5-FE-4 | FE | Fe³⁺ | D2E3 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 5 | 5 | 3 | ✘ |