| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MS7-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 3G3S-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✔ |
| 3ED4-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✔ |
| 4JCO-NA-2 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 4 | 2 | ✔ |
| 4NYP-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 4OEH-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 4IJ7-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✔ |
| 2X2V-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-2 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 2X2V-NA-3 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-4 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-5 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-6 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-7 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 2X2V-NA-8 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 4CBK-NA-1 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 4CBK-NA-2 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 4CBK-NA-3 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 4CBK-NA-4 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 4CBK-NA-5 | NA | Na⁺ | E2 | GLU. | GLU. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |