| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6YFG-CA-7 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-8 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-9 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-11 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-12 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-13 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-14 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-15 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-16 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-17 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-18 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-19 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-20 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-21 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-22 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-23 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-24 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-25 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-26 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-27 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |