| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6YFG-CA-28 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-29 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-30 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-31 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-32 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-33 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-34 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-35 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-36 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-37 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-38 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-39 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-40 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-41 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-42 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-43 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-44 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-45 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-46 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 6YFG-CA-47 | CA | Ca²⁺ | E3 | GLU. | GLU. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |