| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2C13-K-3 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C13-K-4 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C13-K-5 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C13-K-6 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C13-K-7 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C13-K-8 | K | K⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-1 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 2C19-NA-2 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-3 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-4 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-5 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-6 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-7 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2C19-NA-8 | NA | Na⁺ | D2L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2BPG-MG-1 | MG | Mg²⁺ | C1T1V1 | DC.THR.VAL. | DC.THR.VAL. | ✘ | 3 | 3 | 2 | ✔ |
| 1RER-HO-1 | HO | Ho | D3 | ASP. | ASP. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✔ |
| 1RER-HO-2 | HO | Ho | D3 | ASP. | ASP. | ✔ | 3 | 3 | 3 | ✘ |
| 1P1C-GD-1 | GD | GD³⁺ | E1S1 | GLU.SER. | GLU.SER. | ✔ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 4D1O-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | C4 | CYS. | CYS. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4D1P-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | C4 | CYS. | CYS. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |